W 2006 r. Konsulta Wyższych Przełożonych Żeńskich Zgromadzeń Zakonnych zwróciła się do Przełożonej Prowincjalnej Urszulanek Unii Rzymskiej z prośbą o utworzenie Międzyzakonnego Studium Junioratu w ramach działalności Międzyzakonnego Wyższego Instytutu Katechetycznego, prowadzonego przez Urszulanki Unii Rzymskiej w Krakowie.
Zajęcia Międzyzakonnego Studium Junioratu rozpoczęły się od roku akademickiego 2006/2007. W czerwcu 2014 r. Międzyzakonny Wyższy Instytut Katechetyczny należący do Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II zakończył swoją działalność . Natomiast Studium zostało przekształcone w Międzyzakonne Teologiczne Studium Formacyjne, które będzie oferowało wykłady dla sióstr w formacji początkowej.
Studium jest prowadzone przez Zgromadzenie Sióstr Urszulanek Unii Rzymskiej pod patronatem Arcybiskupa Metropolity Krakowskiego.
Wykłady prowadzone są głównie przez pracowników i księży profesorów Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II.